メールにて加藤さんより不具合の報告をいただきましてので、ご報告させていただきます。
まずは下図をご覧下さい。下図は文字が20Qで字間が8Q(字送り28Q)のものです。これにルビをふるとルビがセンターに入らないのです。20Qの文字の真ん中にルビがふられるのではなく、28Qの字送りの真ん中にルビがふられてしまうのです(ちなみに圏点はちゃんと真ん中に表示されます)。
またこの問題は、字間を広げた時だけではなく、字間を詰めた場合にも起こります(下図)。
この問題を解決するにはルビダイアログの[親文字からのオフセット]で調整しましょう(下図)。ルビがたくさんある場合には、ルビの文字数ごとにスタイルを作って対処すると良いようですが、欧文にルビをふる場合は、ルビごとに調整するしかないようです。
この問題についてAdobeのサポートに連絡されたそうで、次期バージョンで直るよう開発に要望を出すという回答をいただいたそうです。