InDesign CSでは、新しく[ブックマーク]パレットが追加されました(下図)。テキストや画像を選択して、[新規ブックマークを作成]ボタンをクリックするだけで、簡単にブックマークを作成できます。
※ブックマークパレットは[ウィンドウ]→[インタラクティブ]から表示できます。
このブックマークには親子関係を持たせることができます。任意の項目を親にしたいブックマークのアイコンにドラッグすればOKです(下図)。もちろん順序も自由に変更できます。
なお、ブックマークパレットから[ブックマークを整列]を選択すると、ページ順(次にアルファベット順)でソートされます(下図)。
この状態からPDFを書き出すと、PDFの「しおり」にもちゃんとブックマーク順に表示されます(下図)。
ただし、PDFに書き出すときは、[ブックマーク]にチェックを入れて下さい(下図)。